1. 단위체
- 뉴클레오타이드 : 5탄당 + 인산기 + 염기
- 염기 : 퓨린 / 피리미딘, 아데닌 시토신 - 아미노 염기, 구아닌 티민 - 케토 염기, 260nm 흡광
2. 연결
- 주형 상보적 뉴클레오타이드 첨가
- 주형 반드시 있어야 뉴클레오타이드 첨가 가능
- Mg2+ : 보결족
- OH의 H+ 제거
3. 안정성/불안정성
- 알칼리 처리 시 : DNA - 이중나선 변성, RNA - 절편화
- 강산성 환경 : 모두 절편화
- Tm : ds 50% 변성 시 온도
* Tm 높을 조건
1) G, C 비율 높
2) 소수성 강
3) 염처리 -> 인산기 제거 -> 척력 감소
4) 적정 pH
- 구조에 의한 안정성/불안정성 : 역반복서열 존재 시 헤어핀 구조 형성
4. ds DNA 종류
- A : 탈수환경, 우나선, 통통
- B : 생리적 환경, 주홈 <- 단백질, 부홈(인산기 노출) <- 히스톤
- Z : 좌나선, G, C 비율 높
5. 상대흡광도를 통한 구조예측(핵산 변성과 재생)
- 상대흡광도
: ds DNA - 1
: ss DNA - 1.37
: single NT - 1.52
- 재생역학 : ds -> ss -> cool down ; 흡광도 감소
: 진핵 - 반복서열 존재 (특징적)
1) 고빈도 : 빠른 재생
2) 중간빈도 : 약간 느린 재생
3) 실제유전자 : 재생 가장 느림
: 원핵 - 반복서열 없고 유전체 양 적음 -> 흡광도 빠르게 감소
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